Otto Comitati (della Commissione) aventi rispettivamente i seguenti domini di competenza: Alimentazione umana, alimentazione animale, veterinaria-salute umana, piante, salute e benessere degli animali, prodotti cosmetici e prodotti non alimentari, medicinali e dispositivi medici, tossicità, ecotossicità e ambiente.
Pareri scientifici sono attualmente formulati da 8 Comitati scientifici e settoriali, 5 dei quali coprono direttamente o indirettamente gli ambiti dei mangimi e degli alimenti.